در قانون اساسی انتخابات مجمع قانون گذاری 67 نفره، رئیس جمهور و دو معاون رئیس جمهور برای دوره‌ای 5 ساله با رای اجباری تمامی افراد بالغ پیش‌بینی شده‌است. رئیس جمهور کابینه وزیران را انتصاب می‌کند. احزاب عمده سیاسی عبارتند از حزب اعتبار لیبرال، حزب دموکرات مسیحی، جنبش آزادی‌بخش جمهوری ملی (که در انتخابات 1989 با عنوان اتحاد دموکراتیک همکاری کردند)، حزب اعتبار پاناما، و (ائتلاف) کولینا .

نوع حکومت پاناما جمهوری است. قوه? مقننه? این کشور از یک مجلس قانونگذار با 71 عضو تشکیل یافته‌است و دوره? عضویت در آن 5 سال است. توزیع کرسی‌های این مجلس قانونگذاری در سال 1999 بدین شرح بود: ائتلاف ملت جدید 410 کرسی، ائتلاف اتحاد پاناما 24 کرسی، سایرین 13 کرسی.

از سال 1999 ریاست حکومت و دولت آن را میریا الیسا موسگوسو رودریگز به عهده داشت. رئیس‌جمهور کنونی ریکاردو مارتینلی است. وی نماینده ائتلاف «اتحاد برای تغییرات» است که این ائتلاف از اتحاد حزب «تغییر دمکراتیک»، حزب «پاناما» و حزب «اتحاد مولینرا و میهن‌دوست» ایجاد شده‌است. خط مشی سیاسی مارتینلی شامل کمک به نظام سرمایه‌داری و احیای قرارداد بازرگانی آزاد با آمریکا است. این سیاستمدار که صاحب بزرگترین فروشگاه‌های زنجیره‌ای کشور است، در انتخابات از بیش از دو میلیون نفر دارای رأی خواست که با آرای خود «از لغزش کشور به سراشیب چپ جلوگیری کنند

معروف‌ترین مسئله سیاسی مربوط به پاناما، بحران آبراه پاناما می‌باشد که با مداخله نظامی آمریکا و کشته شدن 4000 شهروند پانامایی همراه بود.